Sekretariat Badan Standardisasi Instrumen Lingkungan Hidup dan Kehutanan mempunyai tugas melaksanakan koordinasi pelaksanaan tugas dan pemberian dukungan administrasi kepada seluruh unit organisasi di lingkungan badan.
Struktur Organisasi Sekretariat Badan Standardisasi Instrumen Lingkungan Hidup dan Kehutanan sebagai berikut :